Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms