Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac5Q9Z2V6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac5Q9Z2V6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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