Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hdac6Q9Z2V5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms