Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms