Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms