Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Cldn8Q9Z260 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Cldn8Q9Z260 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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