Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp4Q9WV89 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms