Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psma1Q9R1P4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms