Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ntn3Q9R1A3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ntn3Q9R1A3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ntn3Q9R1A3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ntn3Q9R1A3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ntn3Q9R1A3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms