Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Wdr54Q9R0D8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms