Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc5Q9QX29 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc5Q9QX29 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc5Q9QX29 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc5Q9QX29 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc5Q9QX29 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc5Q9QX29 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trpc5Q9QX29 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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