Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Neu3Q9JMH7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Neu3Q9JMH7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Neu3Q9JMH7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Neu3Q9JMH7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Neu3Q9JMH7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Neu3Q9JMH7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Neu3Q9JMH7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Neu3Q9JMH7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Neu3Q9JMH7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Neu3Q9JMH7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Neu3Q9JMH7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Neu3Q9JMH7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Neu3Q9JMH7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms