Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms