Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm1Q9JLF6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms