Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Chrac1Q9JKP8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Chrac1Q9JKP8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Chrac1Q9JKP8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Chrac1Q9JKP8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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