Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms