Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms