Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms