Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tlr1Q9EPQ1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms