Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Tspan4Q9DCK3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Tspan4Q9DCK3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Tspan4Q9DCK3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tspan4Q9DCK3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tspan4Q9DCK3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tspan4Q9DCK3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms