Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrpraQ9DBG7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms