Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp27a1Q9DBG1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms