Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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