Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fip1l1Q9D824 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fip1l1Q9D824 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fip1l1Q9D824 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fip1l1Q9D824 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fip1l1Q9D824 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms