Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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