Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp4cQ9D7F7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms