Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cldn23Q9D7D7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn23Q9D7D7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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