Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtl8cQ9D6I0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtl8cQ9D6I0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtl8cQ9D6I0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtl8cQ9D6I0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtl8cQ9D6I0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtl8cQ9D6I0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rtl8cQ9D6I0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms