Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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