Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms