Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx29Q9D3S3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms