Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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