Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zbed3Q9D0L1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zbed3Q9D0L1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zbed3Q9D0L1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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