Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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