Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Exo5Q9CXP9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Exo5Q9CXP9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Exo5Q9CXP9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Exo5Q9CXP9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Exo5Q9CXP9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Exo5Q9CXP9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Exo5Q9CXP9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Exo5Q9CXP9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Exo5Q9CXP9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Exo5Q9CXP9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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