Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RpainQ9CWY9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RpainQ9CWY9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RpainQ9CWY9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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