Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms