Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q9CRC3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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