Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms