Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms