Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Nicn1Q9CQM0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Nicn1Q9CQM0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Nicn1Q9CQM0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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