Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Rab5aQ9CQD1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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