Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms