Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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