Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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