Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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