Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl3Q99N95 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl3Q99N95 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms