Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hdac9Q99N13 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hdac9Q99N13 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hdac9Q99N13 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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