Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms