Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lactb2Q99KR3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms